Svenske Truls Möregårdh tog första set men förlorade sedan tre raka mot den lägre rankade portugisen.

Freitas vann efter 9–11, 11–9, 11–9, 11–4.

En besvikelse för Möregårdh, som gick till semifinal i turneringen förra året.

Europe Top-16 är en prestigefylld årlig turnering som samlar de högst rankade europeiska spelarna.

Linda Bergström kvar i damsingeln

De senaste åren har turneringen spelats i Montreux i Schweiz.

Den har tidigare hetat Europe Top-12 och Jan-Ove Waldner och tyske Timo Boll har vunnit titeln flest gånger med sju segrar vardera.

Svenska Linda Bergström spelar sin åttonsdelfinal i damsingeln klockan 21.20 i kväll. Hon ställs mot franska Charlotte Lutz. Inga svenskar är kvar i herrsingeln.