update
Для этого надо выполнить небольшое количество действий в форкнутом проекте:
Перейти на вкладку Pull Requests
Создаем новый реквест New pull request
Пишет, что нечего сравнивать, но не расстраиваемся и жмем switching the base
Появились отличия родительского и форкнутого проектов. Жмем Create pull request и даем ему название
Автоматически оказываемся в этом пул реквесте и жмем Merge pull request
И напоследок Confirm merge
PROFIT
Теперь мы имеем форкнутый репозиторий со всеми изменениями из родительского проекта.